持续加强流域水生态环境管理，统筹水资源、水环境、水生态治理，进一步强化伊犁河流域水生态环境保护。深入开展水污染防治，严守水资源“三条红线”，深化落实河（湖）长制，强化重点流域污染防治，着力推动州直水生态环境质量持续改善。加强入河（湖）排污口监督管理，排查、溯源、整治入河排污口68个，有效管控入河（湖）污染物排放，持续开展城市黑臭水体排查整治，不断提升环境治理能力和水平。完成17个县级以上集中式饮用水水源环境状况评估，积极推动乡镇级集中式饮用水水源保护区划定工作，依法整治饮用水水源保护区内环境违法行为。持续做好饮用水水源保护区规范化管理工作，强化饮用水源地保护。编制完成《伊犁州直地下水污染防治重点区划定技术报告》，编制完成《伊犁州直地下水污染防治重点区划定方案》，确定州直地下水污染防治保护类区域248.6136km²、管控类区域3299.1600km²。根据水环境监测情况，2025年，伊犁州直重点监测的河流监测断面和湖库监测点位，县级以上集中式水源地水质优良（达到或优于Ⅲ类）比例为100%，水环境质量持续稳定。